Geboren als Imran Pal in Madison, Wisconsin, USA, als Sohn von Anil Pal, einem Softwareentwickler, und Nuzhat Khan, einer Psychologin. Imrans Großvater war ein Bengale, der eine Britin heiratete. Imrans Vater ist ein bengalischer Hindu, der bei Mansoor Khan am IIT Bombay studierte und jetzt als leitender Manager bei Yahoo in Kalifornien arbeitet. Imran Khans Mutter ist Muslimin aus einer Filmfamilie, Tochter des Regisseurs und Produzenten Nasir Hussain, Schwester des Regisseurs und Produzenten Mansoor Khan und Cousine des Schauspielers Aamir Khan. Imran Khan ist gebürtiger amerikanischer Staatsbürger. Khans Eltern ließen sich scheiden, als er noch ein Kleinkind war, woraufhin seine Mutter nach Mumbai zog. In einem Interview nannte Imran Khan seinen Stiefvater Raj Zutshi als Vaterfigur während seiner heranwachsenden Jahre. Er wurde an der Bombay Scottish School eingeschrieben, wo er körperlichen Züchtigungen wie Prügelstrafen ausgesetzt war. Laut Imran Khan entwickelte er ein Stottern, seine Noten fielen und seine akademische Karriere geriet aufgrund seiner Unfähigkeit, mit seiner neuen Umgebung und radikal veränderten Familiensituation fertig zu werden, in einen „starken Rückgang“; er wurde nervös und entwickelte Gesichtszüge. Imran Khan zog dann nach Sunnyvale, Kalifornien, wo er mit seinem Vater lebte und die Fremont High School besuchte. Nach seinem Abschluss strebte er danach, Filmregisseur zu werden, und ging nach Los Angeles, um an der Niederlassung der New York Film Academy in Los Angeles einen Abschluss in Filmemachen zu machen. Khan studierte Regie, Schreiben und Kamera und wurde vom Schriftsteller Roald Dahl inspiriert. Nach seinem Abschluss wagte er sich in die Marktforschung und Werbung. Schließlich kehrte er nach Mumbai zurück und trainierte am Kishore Namit Kapoor Acting Institute. Während seiner Ausbildung am Schauspielinstitut begann Imran Khan sich zu vernetzen und lernte den Drehbuchautor und Regisseur Abbas Tyrewala kennen, der ihm die Hauptrolle in Jaane Tu... Ya Jaane Na (2008) anbot. Nachdem Produzent Jhamu Sugandh in finanzielle Schwierigkeiten geriet, boten sie Aamir Khan das Drehbuch an, der sich bereit erklärte, den Film zu finanzieren. Dann erhielt die romantische Komödie positive Kritiken und war ein kommerzieller Erfolg, der weltweit 830 Millionen Pfund (10 Millionen US-Dollar) einbrachte.
Abgesehen von seiner Rolle in Filmen ist Imran Khan ein sozialer Aktivist und hat Kolumnen für die Hindustan Times geschrieben. Er ist ein Unterstützer von PETA „People for the Ethical Treatment of Animals“ und trat bei Veranstaltungen auf, die für die Gruppe organisiert wurden.